ลิโกะ สาวน้อยจากภูมิภาคพัลเดียผู้ใฝ่ฝันจะเป็นโปเกมอนเทรนเนอร์ ได้เข้าเรียนที่สถาบันอินดิโกในภูมิภาคคันโต และเลือก เนียวฮะ โปเกมอนตัวน่ารักเป็นคู่หู แต่ความสุขยังไม่ทันจะเริ่มต้น ลิโกะก็ต้องเจอกับเหตุการณ์ไม่คาดฝัน เมื่อ ทีมเอกซ์พลอเรอร์ มาแย่งจี้ห้อยคอที่เธอได้รับมาจากคุณยายไป! โชคยังเข้าข้างลิโกะ เมื่อ กลุ่ม Rising Volt Tacklers เข้ามาช่วยเหลือไว้ได้ ทำให้เธอได้ร่วมผจญภัยไปกับ
กลุ่มนี้ ซึ่งประกอบด้วยเด็กหนุ่มสาวที่รักในการผจญภัยและการฝึกโปเกมอนเช่นกัน ระหว่างการเดินทาง ลิโกะได้พบกับ รอย เด็กชายอีกคนที่เดินทางมาพร้อมกับ โฮเกเตอร์ โปเกมอนคู่หูของเขา รอยกำลังตามหาโปเกมอนในตำนานอย่าง เรย์ควาซา ที่ออกมาจากโปเกบอลโบราณที่เขาได้รับมาจากปู่ และด้วยความที่อยากสำรวจโลกกว้าง รอยจึงตัดสินใจเข้าร่วมทีม Rising Volt Tacklers ด้วย การผจญ
ภัยของลิโกะและรอย เต็มไปด้วยความสนุกสนานและน่าตื่นเต้น พวกเขาได้เดินทางไปยังสถานที่ต่างๆ มากมาย พบเจอกับโปเกมอนสายพันธุ์ใหม่ๆ และต้องเผชิญหน้ากับอุปสรรคต่างๆ นานา ระหว่างทาง ลิโกะและรอยได้เรียนรู้ที่จะใช้ไอเท็มต่างๆ เพื่อดูแลโปเกมอนของตนเอง เรียนรู้ที่จะทำงานร่วมกับเพื่อนๆ ในทีม และค้นพบความสามารถที่ซ่อนอยู่ในตัวของตัวเอง
